Attacken mot vad som verkar vara slumpmässigt utvalda offer ägde rum vid 5-tiden på morgonen vid en pendelstation i Grafing.
En 27-årig man, som uppges vara tysk medborgare, kunde gripas strax därefter. Han uppges ha ropat "Allahu akbar" (arabiska för "Gud är större") och "ni otrogna" i samband med attacken.
Fyra män mellan 43 och 58 år skadades allvarligt i dådet och en av dem, en 50-åring, dog av sina skador, enligt lokaltidningen Merkur.
Polisen misstänker att knivattacken kan ha politiska motiv.