De båda invandrarna ska inte ha utfört de misstänkta våldtäkterna tillsammans, men polisen kommer ändå utreda brotten ihop.
Det rör sig nämligen om samma brottsoffer, ett barn under 15 år som ska ha våldtagits totalt sex gånger.
Enligt SVT fick polisen in den först anmälan om en misstänkt våldtäkt föra cirka fyra veckor sedan. Den ska skett i anslutning till en hiss vid gångtunneln vid Bodens järnvägsstation. Därefter ska det ha inträffat ytterligare fem våldtäkter i staden.
Afghanen, som är medborgare i Afghanistan, sägs vara född 2000 och behöver tolk på dari, ska ha utfört våldtäkt mot barn vid två tillfällen.
Den libanesiska pojken, som är medborgare i Libanon, sägs vara född 2002 och behöver tolk på arabiska, ska ha utfört våldtäkt mot barn vid fyra tillfällen, på samma dagar som afghanen: 22 respektive 23 maj. Han är även misstänkt för övergrepp i rättssak.
– Det är sex olika gärningar begångna under två dagar på olika platser i Boden. Men brotten har inte begåtts tillsammans och i samförstånd, säger jouråklagare Anna Väppling till SVT.
Den 16-årige libanesen ska ha varit 15 år vid brottstillfället. Att häkta så unga personer är ovanligt. Det krävs synnerliga skäl, som att underlätta utredningen och förhindra fortsatt brottslighet.
Båda två har häktats på sannolika skäl, den högre misstankegraden.