EU:s utvidgningskommissionär Stefan Fühle sa i ett uttalande på torsdagen att han beklagar myndigheternas agerande.
Jag fördömer starkt de hot som kommit från extremistorganisationer i Serbien riktade mot organisatörerna av Pride och jag beklagar att dessa hot har uppfattats som tillräckligt allvarliga för att legitimera ett förbud på grund av säkerhetsskäl, sade Stefan Füle enligt Europaportalen.
Även ledamöter i Europaparlamentet har reagerat. Holländska Marije Cornelissen (de Gröna), som är i Serbien med anledning av Prideveckan, säger till Brysseltidningen EurActiv att det är illa att Serbien antingen inte vill, eller inte kan, skydda medborgarna och mötesfriheten.
Jag kommer rekommendera EU-kommissionen att inte godkänna att anslutningsförhandlingar inleds, säger Cornelissen till EurActiv.
Serbiens premiärminister Ivica Da?i? ska enligt BBC sagt att ingen ska säga till någon vad som ska hända i Belgrad, varken EU, något annat land eller någon extremistisk eller rasistisk organisation.
Premiärministern fördömde också den svenska kulturmarxistiska utställningen Ecce Homo som skulle ha visats i samband med Pride.