Enligt Dublinförordningen ska en asylsökare få sin sak prövad i det första EU-land personen kommer till.
Ungern var första EU-land för många asylsökare förra året, men nu vägrar landet att ta tillbaka dem som avvisas tillbaka till Ungern från andra länder.
Justitie- och migrationsminister Morgan Johansson säger till TT att han nästa vecka kommer att kalla upp den ungerska ambassadören för att protestera. Han kommer också be EU-kommissionen att agera.
– Det är ett oacceptabelt agerande, säger Johansson till TT.
Drygt 1.000 asylsökare i Sverige har fått besked om att de ska skickas tillbaka till Ungern för att få sin sak prövad där.