Cirka 150 illegala invandrare från i första hand Eritrea, togs ombord av det italienska kustbevakningens skepp Ubaldo Diciotti, som kom till Sicilien i måndags.
Men italienska myndigheter har bara låtit barn och sjuka stiga i land från fartyget, enligt Reuters.
I helgen har Albanien, Irland och katolska kyrkan gått med på att ta emot afrikanerna.
Den italienska regeringen har kritiserats av bland annat UNHCR för sin hantering av situationen. Och nu har en åklagare på Sicilien beslutat att utreda inrikesminister Matteo Salvini, som företräder invandringskritiska Lega, för brott mot Europakonventionen.
Enligt Yle utreds Salvini för maktmissbruk, kidnappning och olagligt anhållande.
– Att utredas för att ha försvarat italienarnas rättigheter är en skam, sade Salvini till sina anhängare på lördagskvällen.
I ett inlägg på Facebook riktar sig ministern till åklagaren som startat förundersökningen.
"Om du vill vill arrestera mig för att jag försvarar gränserna och säkerheten i mitt land så är jag stolt över det", skriver Salvini enligt SVT.