Bönderna använde traktorer och släp för att dumpa kronärtskockor, blomkål och gödsel på gatorna och de krossade även fönster, säger polisen till BBC.
Premiärminister Manuel Valls fördömde demonstranternas försök att hindra brandmän från att nå fram till branden.
Bönderna säger att de inte kan klara av de fallande priser på jordbruksprodukter som det antiryska embargot leder till.
Sanktionerna från väst har lett till ett ryskt importförbud mot vissa västerländska varor, vilket har blockerat en av de europeiska böndernas viktigaste exportmarknader.
Svenskar knyter näven i fickan
Rysslands handelsstopp slår även för fullt mot de svenska mjölkbönderna. Det senaste halvåret har mjölkpriset till många av landets bönder sjunkit flera gånger, och mjölkpriserna på världsmarknaden fortsätter att falla på grund av ett större utbud och en svagare efterfrågan.
– Många börjar bli väldigt uppgivna. Många ger upp snart. Det kommer bli många som lägger av är jag rädd. Vi kommer snart inte ha några mjölkproducenter kvar i det här landet, om inte något dramatiskt sker, säger mjölkproducenten Åsa Augustsson i Istrum utanför Skara till Sveriges Radio.
