Bland annat uppges ambassaderna i Israel, Tyskland, Brasilien och Lettland ha fått avslag på sina ansökningar om att hissa prideflaggan i juni.
Enligt NBC News är det särskilt obehagligt att ambassaden i Berlin inte får HBT-flagga eftersom den amerikanske ambassadören där, Richard Grenell, har utmålat sig som en förkämpe för homosexuella. Grenell är också själv helt öppet homosexuell.
Den förre presidenten Barack Obama gav alla amerikanska ambassader tillåtelse att hissa regnbågsflaggan på sina officiella flaggstångar under juni månad.
Under Trump har amerikanska UD dock krävt att ambassaderna ansöker om tillstånd att använda de officiella flaggstångarna i detta syfte.
En talesperson för USA:s ambassad i Berlin lovar dock att regnbågsflaggor kommer att hängas upp "på så många platser som möjligt" på i ambassaden under pridemånaden, enligt NBC.
