Massgravarna innehåller tusentals människor som föll offer för den islamistiska terrorsektens "kalifat" som upprättades i området 2014.
Den minsta massgraven innehåller åtta kroppar, medan den största består av 4.000 dödade människor.
Bland de döda finns kvinnor, barn, äldre och funktionshindrade, likaså medlemmar av Iraks militär och polis.
Enligt FN ska Islamiska Staten ha dödat 33.000 civila i Irak och skadat över 55.000.
I de massgravar som nu hittats finns det totalt mellan 6 000-12 000 kroppar. Någon exakt siffra har ännu inte kunnat tas fram.
Massgravarna är koncentrerade i de fyra provinser i Irak – Ninewa, Kiruk, Salah al-Din och Anbar – där IS förskansade sig innan de besegrades i december 2017, skriver Haaretz. Dessa provinser ligger i landets norra och västra delar nära gränsen till Syrien.