Kommentaren fälldes under Muhammadu Buharis besök i Berlin i slutet av förra veckan.
CNN noterar att kvinnokämpen Angela Merkel, som befann sig i samma rum, inte verkade reagera alls på det som den afrikanske kollegan sade.
– Jag vet inte vilket parti min fru tillhör men hon hör hemma i mitt kök och i mitt vardagsrum och i det andra rummet, förklarade den nigerianske presidenten under presskonferensen.
Bakgrunden till utspelet är att Muhammadus fru Aisha (med samma namn som profeten Muhammeds sexåriga hustru) i en intervju med BBC flaggat för att hon skulle kunna avstå från att rösta på sin man i det kommande valet om han inte gör ändringar i regeringsbildningen.
Muhammadu Buhari anklagas för nu att vara sexist på sociala medier, men enligt hans talesman Garba Shehu var uttalandet bara ett uttryck för humor, rapporterar CNN.