Det var under en husrannsakan hemma hos mannen som polisen hittade ett usb-minne med barnporr gömt inuti ett etui beprytt med en bild av Jesus.
Polisen hittade även bilder i mannens mobiltelefon och dator.
Sammanlagt handlar det om 2421 bilder och 491 filmer, varav 640 bilder och 341 filmer bedöms som särskilt hänsynslösa och grova, uppger Smålandsposten, som tagit del av protokollet över husrannsakan.
Mannen ska även ha delat materialet med andra, bland annat genom att byta usb-minne med en annan man.
I onsdags åtalades den förre kyrkochefen vid Växjö tingsrätt för sexövergrepp mot en 14-årig pojke, kränkande fotografering, barnpornografibrott samt grovt barnpornografibrott.
Den åtalade mannen, som bor i en villa på en ort i Kronobergs län, ska självmant ha sagt upp sig från Svenska kyrkan.