Duterte, som i december förra året ännu var borgmästare i Filippinernas fjärde största stad Davao City, spelade in den 20 sekunder långa valfilmen inför presidentvalet i våras där han vann en jordskredsseger.
– Ni vet, jag är fortfarande bara en människa. Så låt mig framföra en hälsning; god jul till er knarkare, tjuvar, korrupta kriminella och alla andra som gör livet hårt för filippinierna, säger Duterte i videon.
– Men om ni inte slutar och fortsätter med er brutalitet, så kommer detta bli er sista goda jul!
Videon blev en omedelbar succé i ett land plågat av korruption och organiserad kriminalitet. Den har visats på biografer och en ljudversion av den har spelats upp i radio, skriver Dhaka Tribune.
Sedan Duterte tillträdde posten som president 1 juli har han infriat sitt vallöfte och beslutat sig för att, bokstavligt talat, utrota landets kriminella. Enligt en artikel i brittiska Mirror som publicerades igår har mer än 2.000 knarkförsäljare dödats av polisen och ytterligare 3.000 dödsfall misstänks vara utomrättsliga avrättningar.
Dödandet är så omfattande att begravningsentreprenörer klagar på att de inte hinner ta hand om alla lik, något landets nye president visserligen förvarnat om.
– Bårhusen kommer att vara fulla, jag kommer se till att de har döda kroppar, sade han under valrörelsen.
Duterte har till och med jämfört sig själv med Nazitysklands ledare Adolf Hitler och talat om att utrota miljoner kriminella och drogberoende.
Den filippinske presidentens hårda framfart mot landets kriminella och de många utomrättsliga avrättningarna har kritiserats av västvärlden.