Sjojgu talade under onsdagen på en säkerhetskonferens i Moskva där han upprepade den ryska linjen att attacken var ett allvarligt brott mot internationell rätt. USA hävdar å sin sida att den utfördes som svar på en gasattack som man anklagar regeringssidan för.
USA förvarnade Ryssland om attacken mot flygbasen i Homs som natten till 7 april bombades med Tomahawk-missiler. Trots det menar den ryske försvarsministern att attacken utgjorde ett allvarligt hot mot rysk militär personal i landet.
– Washingtons agerande skapade ett livsfarligt hot mot våra soldater som bekämpar terrorismen i Syrien, säger Sjojgu.
– Sådant agerande tvingar oss att vidta åtgärder för att säkerställa våra ryska truppers säkerhet.
Av satellitbilder att döma fanns troligen såväl ryska specialstyrkor som ryska militärhelikoptrar på basen som bombades. Soldaterna deltar i den rysk-syriska kampen mot Islamiska staten och andra islamistiska rebellgrupper i landet varav några tidigare stöttats av västvärlden.
Rysslands premiärminister Dmitrij Medvedev har tidigare sagt att den amerikanska attacken var ett steg från en direkt attack på Rysslands militär.