Daniel Russel, assisterande statsråd för USA:s politik i Östeuropa och Stilla havet, talade om Dutertes utspel som ett "allvarligt misstag" och hotade med så kallad "folkets makt".
– Jag tror det vore ett allvarligt misstag i ett demokratiskt land som Filippinerna att underskatta folkets samhörighet med USA. Det är folkets makt, sade han.
Den amerikanska nyhetsbyrån AP drar paralleller till störtandet av Filippinernas president Ferdinand Marcos 1986 i ett uppror som kallades just "folkets makt"-revolutionen.
Filippinerna och USA är allierade med varandra och brukar regelbundet genomföra gemensamma militärövningar. För USA är landet strategiskt viktigt placerat öster om Sydkinesiska havet där USA vill förhindra en kinesisk expansion.
Dutertes prat om att stoppa framtida militärövningar med USA oroar därför Vita huset. Den förra filippinska regeringen skrev under ett avtal som ger USA tillgång till fem filippinska militärbaser, ett avtal som även det nu kan vara i fara.
Under gårdagen jämförde Duterte sig själv med Nazitysklands diktator Adolf Hitler i sin kamp mot landets kriminella.
– Hitler massakrerade tre miljoner judar. Det finns tre miljoner drogberoende i Filippinerna och jag skulle gärna slakta dem, sade han.
– Tyskland hade Hitler, Filippinerna har mig. Mina offer är, ni vet, jag vill komma åt alla kriminella. Jag vill få ett slut på mitt lands problem och rädda nästa generation!
När USA och EU protesterade mot ordvalen och judiska lobbyister i USA anklagade Duterte för att använda sig av en "motbjudande retorik" och krävde en ursäkt hånade Duterte kritikerna.
– Försök inte låtsas vara ett världssamvete. Försök inte agera någon slags polis för den befogenheten har ni inte i mitt land, sade han.
