Det var i måndags när Zuma argumenterade för sina planer på att införa elektroniska biltullar på motorvägarna runt omkring Johannesburg som det kontroversiella uttalandet slank ur honom.
Vi kan inte tänka som afrikaner i Afrika i allmänhet. Det här är Johannesburg. Det är inte någon landsväg i Malawi, sade Zuma när talade på ett öppet möte arrangerat av ANC.
Uttalandet gick omedelbart viralt på sociala medier, skriver New Zimbabwe.
I tisdags sade Zumas kansli att citatet hade ryckts ur sitt sammanhang.
Malawi kallade på onsdagen till sig sydafrikanska toppdiplomater för att protestera mot uttalandet.
Planerna på biltullar mellan Johannesburg och huvudstaden Pretoria har stött på hårt motstånd från allmänheten i Sydafrika.
Motorvägarna uppgraderades i samband med Fotbolls-VM 2010 och ska nu finansieras i efterhand, uppger BBC.
Läs också:
Sverige ger Sydafrika 101 miljoner bygger palatskomplex för 186 miljoner
Här uppmanar Sydafrikas president till mord på vita
