Insatsen ägde rum i Friedrichshain på söndagen där polisen grep flera personer vid ett läger för hemlösa.
Operationen, som 130 poliser deltog i, resulterade dock i att de gripna släpptes.
Måltavlorna Ernst-Volker Staub och Burkhard Garweg, medlemmar i den vänsterextrema terrororganisationen Röda arméfraktionen (RAF), även kallad Baader-Meinhof-ligan, återfanns inte bland de gripna.
RAF var ansvariga för över 30 mord, kidnappningar och sprängningar under 1970- och 80-talen. Det påstådda målet med verksamheten var att bevisa att de liberaler som styrde "egentligen" var fascister.
En tredje misstänkt medlem, Daniela Klette, 65, greps tidigare i sitt hem i Berlin för en vecka sedan. Hon hade då varit på flykt i över tre årtionden. Efter RAF:s upplösning 1998 misstänks Klette, Staub och Garweg för att ha fortsatt sin kriminella bana genom att utföra rån mot värdetransporter och mataffärer.