Erkännandet skedde inför en domstol i Los Angeles där juryn just skulle börja väljas inför rättegången.
Biden står nu inför ett potentiellt fängelsestraff på upp till 17 år, och domen väntas meddelas den 16 december.
Under rättegångsdagen försökte Biden först nå en så kallad Alford-överenskommelse, där han skulle erkänna sig skyldig utan att medge ansvar.
Åklagarsidan motsatte sig dock detta och kallade det ett "hån mot rättvisan". Åklagarna insisterade på att Hunter Biden inte var oskyldig och att han inte förtjänade någon specialbehandling.
Hunter Biden åtalades i december för att ha undvikit att betala minst 1,4 miljoner dollar i federala skatter.
Åtalet beskriver hur han mellan 2016 och 2019 tjänade över 7 miljoner dollar genom affärsverksamheter utomlands men brände pengarna på lyx, droger, prostituerade, hotellnotor med mera, istället för att deklarera och betala skatt.
I sitt uttalande förklarade Hunter Biden att han inte kunde utsätta sin familj för mer lidande och offentlig förnedring, och att han därför erkände sig skyldig.
Han erkände också att hans party- och knarkvanor bidrog till hans oförmåga att betala sina skatter i tid.
Den politiska dimensionen av fallet minskade efter att president Joe Biden meddelade att han inte skulle ställa upp för omval.
Det har dock spekulerats om att presidenten kommer att benåda sin son innan hans mandatperiod tar slut, något som Vita Huset hittills förnekat.