Polisen larmas klockan 23:46 på måndagen till centrala Malmö. Ett vittne hade observerat flera personer krypa runt bland fordon på en parkering.
Flera patruller skickades till platsen och de tre misstänkta, två män och en kvinna, togs på bar gärning.
En lång rad fordon har fått sina däck tömda på luft. Enligt polisen är det åtminstone 25 bilar som drabbats.
Klimataktivisterna lämnade även flygblad på de bilar som man tömt däcken på.
Bilarna stod parkerade på Löjtnatsgatan, Hantverkargatan och Mäster Danielsgatan.
Trion misstänks för egenmäktigt förfarande.