Fritzon fick ersättningarna för i EU:s regionkommitté i Bryssel under förra året, rapporterar P4 Kristianstad.
S-toppen ansåg sedan att hon inte skulle behöva betala skatt för beloppet, på cirka 142.000 kronor, och undanhöll det i sin deklaration.
Skatteverket anser dock annorlunda och slår fast att migrationsministern ska deklarera EU-inkomsterna. Det är enbart på tjänsteresorna i Bryssel hon får göra avdrag, enligt myndigheten.
Heléne Fritzon hänvisar i en skrivelse till att politiker som företräder EU:s medlemsländer enligt EU:s lagstiftning ska ha "särskilda privilegier" och slippa nationell beskattning för ersättningarna, enligt P4 Kristianstad.