Al Jazeera har lagt ut videoklipp som visar en rad döda och skadade, och ögonvittnen berättar att det fortfarande finns oidentifierade kroppar på vägen.
Jadallah al-Shafei, chef för sjuksköterskorna vid al-Shifa-sjukhuset, kallar situationen obeskrivlig.
– Vi hoppas att vi ska kunna ge livräddande hjälp till de skadade. Alla är i kritiskt tillstånd, liggandes på golvet. Vi står hjälplösa mitt i denna brist på förnödenheter och personal.
Det palestinska utrikesministeriet fördömer attacken och beskriver den som en kallblodig "massaker" på civila.
Den israeliska armén, IDF, har meddelat att man undersöker rapporterna, enligt AP.
Enligt det palestinska hälsodepartementet har nu över 30.000 personer i Gaza dödats i Israels krig sedan i oktober. Det motsvarar 1,3 procent av befolkningen i området, skriver BBC News.