Den 52-årige banktjänstemannen, identifierad som Vincenzo Coviello, har förklarat att hans handlingar motiverades av "nyfikenhet" och att han aldrig stulit pengar eller laddat ner några dokument.
Förutom Meloni och hennes syster Arianna ska även Italiens försvarsminister Guido Crosetto och Puglias guvernör Michele Emiliano ha varit bland de drabbade.
Enligt Corriere della Sera började utredningen i augusti efter att en lokal affärsman upptäckt misstänkt aktivitet på sitt konto och anmälde det till polisen.
Vidare undersökningar avslöjade att Coviello på egen hand tillgång till känslig data. Efter att intrången uppdagats av en chef på banken, avskedades Coviello omedelbart.