Det lilla partiet, som riktar sig till "liberalkonservativa" väljare, ansökte i maj om att vara betalande utställare i Pride Park.
Men i förra veckan kom beskedet att Medborgerlig framtid inte tillåts delta i HBTQ-evenemanget.
Stockholm Prides styrelse skriver att "Medborgerlig Samling inte till fullo lever upp till Stockholm Prides värdegrund".
Partiledaren Ilan Sadé anser att Pride begår "ett gigantiskt misstag", enligt ett pressmeddelande.
– I livsstilsfrågor är vi frihetliga och ställer oss helhjärtat bakom homo- och bisexuellas och transpersoners rättigheter, och vi är motståndare till all form av rasism och diskriminering, bedyrar Ilan Sadé.
Medborgerlig Samling kommer nu istället att "genomföra ett eget arrangemang i Stockholm under Prideveckan", enligt pressmeddelandet.
