Bharara skriver själv på Twitter att han inte sade upp sig frivilligt efter att ha uppmanats göra det av USA:s justitiedepartement.
"Jag sade inte upp mig. För en stund sedan fick jag sparken. Att vara åklagare för New Yorks södra distrikt kommer för alltid det mest hedervärda i min karriär", twittrar han.
Tidigare i veckan meddelade USA:s justitieminister Jeff Sessions att han uppmanat 46 politiskt tillsatta federala chefsåklagare att säga upp sig. Åklagarna nominerades under president Barack Obamas tid vid makten. Förfarandet är en rutinåtgärd och något som alla nytillträdda presidenter brukar göra.
Avskedandet uppmärksammats stort av i synnerhet vänsterliberal media. Delvis för att Trump tidigare lovat Bharara att han skulle få vara kvar, något som han nu tycks ha backat ifrån. Att Trump ändrat sig kan bero på det hårda motstånd hans exekutiva ordrar mött där federala domare och andra jurister försökt stoppa dem, trots dess stora stöd bland allmänheten.
I did not resign. Moments ago I was fired. Being the US Attorney in SDNY will forever be the greatest honor of my professional life.
— Preet Bharara (@PreetBharara) March 11, 2017