Rektorn Andre Pearson i Colorado förbjöd vita barn att delta i extraundervisningen efter ordinarie skoltid.
Till elevernas föräldrar skickade han ut ett brev i vilket han berättade att endast "färgade" barn skulle få kunna delta i programmet för barn med extra undervisningsbehov.
Rektorn i skolan Mission Viejo Elementary i Aurora säger till en av föräldrarna till en vit elev att programmet är utformat för "färgade" barn och fokuserar på "färgade" barn.
En talesperson vid skoldistriktet har efteråt gått ut och sagt att allt är ett missförstånd och att man kommer att anta även vita barn.
Programmet sattes igång av föräldrar till icke-vita barn i ett försök att få icke-vita barn att överbrygga prestationsgapet till vita barn. Skoldistriktet klargjorde i efterhand att syftet med programmet inte var segregera vita barn.