Den 28-årige mannen åtalas för att ha kört på pojken, som cyklade över ett övergångsställe i Valsta i Sigtuna kommun den 7 juni 2023.
Elvaåringen fick så allvarliga skador att han senare avled.
Den åtalade mannen kommer från Irak men har fått svenskt medborgarskap och kan därför inte utvisas. Han uppges vara en del av det kriminella invandrargänget Märstanätverket och är välkänd av polisen. Han har tidigare dömts i tingsrätten för ett mord, men friades i hovrätten av bevisskäl.
28-åringen var inledningsvis anhållen men släpptes av åklagaren, som gjorde bedömningen att utredningen inte krävde att mannen var frihetsberövad.
Utredningen är nu slutförd och åtal har väckts för brotten vållande till annans död och vårdslöshet i trafik.
– Förundersökningen har enligt min uppfattning visat att mannen har varit oaktsam när han passerade övergångsstället. Det krävs ett större mått av försiktighet vid ett obevakat övergångsställe och han har genom påkörningen orsakat pojkens död, säger statsåklagare Daniel Suneson i ett uttalande.