Mötet sker i samband med att Jens Stoltenberg besöker Sverige nästa vecka.
Enligt statsminister Ulf Kristersson (M) är syftet är att ge partiledarna möjlighet att få Nato-chefens bild av läget och diskutera den fortsatta processen.
Vänsterpartiet och Miljöpartiet får dock inte delta, vilket får partierna att reagera.
Håkan Svenneling, utrikespolitiskt talesperson för Vänsterpartiet, säger till Aftonbladet att det rör sig om "ett tydligt brott mot den ordning vi tidigare har haft".
– Jag antar att det är lättare att ha ett möte där alla håller med varandra, än där det finns såna som har ett annat perspektiv, säger Svenneling.
MP:s språkrör Märta Stenevi är också kritisk till Ulf Kristerssons agerande.
"Det här är den största försvarspolitiska förändringen i Sverige under modern tid. Det är anmärkningsvärt och beklagligt att regeringen nu väljer att inte bjuda in samtliga partier till mötet med Stoltenberg", skriver hon i en kommentar till Aftonbladet.
