Greta befann sig på Malta när hjälpfartyget The Conscience, som skulle föra förnödenheter till Gaza, utsattes för en drönarattack under natten mot fredag.
Fartyget låg då på internationellt vatten utanför Maltas kust.
– Det var ganska chockerande att det skulle hända så här nära ett EU-land, säger Thunberg till Aftonbladet.
Skeppet skadades i förskeppet och tog in vatten efter att, enligt organisationen Freedom Flotilla, ha träffats av en drönare riktad mot generatorn. Branden ombord släcktes senare, och ingen i besättningen eller bland passagerarna skadades.
Greta, som suttit fast i Malta på grund av vad hon kallar "byråkratisk krigföring", skulle ha gått ombord två dagar före attacken. Hon misstänker att Israel eller dess allierade ligger bakom händelsen.
Israel har fortsatt att stoppa alla försök att föra in nödhjälp i Gaza, trots akut hungersnöd i området, och enligt kritiker är syftet helt enkelt att svälta ut den redan hårt drabbade civilbefolkningen.
– Ship to Gaza och Freedom Flotilla har försökt skicka 35 båtar för att bryta Israels illegala blockad mot Gaza. Tidigare har Israel stoppat nästan varenda båt, säger Greta till Aftonbladet.
Trots attacken säger den svenska klimatprofilen att hon och andra aktivister kommer att fortsätta sitt arbete för att "ställa krigsförbrytare till svars" och bryta det hon kallar för västvärldens "medskyldighet till folkmord".
