Enligt planen ska USA kunna stötta de "moderata" rebellerna i landet. Även Isis och liknande grupper, som USA samtidigt bombar i Irak, räknas till rebellsidan.
Totalt 500 miljoner dollar ska gå till beväpning och utbildning av syriska rebeller och till utbyggnaden av USA:s militära insatser i Irak.
Den syriska regeringen har tidigare erbjudit sig att samarbeta med USA i kampen mot Isis. USA har dock ignorerat inviten, och förra veckan deklarerade Barack Obama att han tänker tillåta flygbombningar inne i Syrien utan den syriska regeringens medgivande, något som skulle innebära ett brott emot folkrätten.
– Jag har gjort det klart att vi kommer att jaga rätt på terrorister som hotar vårt land, oavsett var de är. Det betyder att jag kommer inte tvekar att vidta åtgärder mot IS i Syrien, liksom i Irak, sade presidenten enligt Fox News.
Islamiska staten ser shiamuslimer som sina fiender. Al-Assad är alawit, det vill säga tillhör en muslimsk grupp som står shiiterna nära.
Syriens utrikesminsiter Walid Muallem har varnat USA för att genomföra flygattacker på syrisk mark.
– Vi är redo för ett samarbete med USA och Storbritannien. Men militära operationer som inte koordineras med den syriska regeringen kommer att betraktas som aggression mot Syrien. Regeringen blir då tvungen att vidta åtgärder för att skydda landets suveränitet, sade Muallem.
Bakgrunden till den nuvarande situationen i Irak är att Obamas företrädare George W. Bush år 2003 startade ett folkrättsvidrigt krig mot landet efter att ha ljugit om att presidenten Saddam Hussein hade massförstörelsevapen. Sedan dess har landet slitits sönder av anarki och stridigheter.