I en intervju med Die Zeit säger Merz att ett förbud skulle "lukta alltför mycket av att eliminera politiska rivaler".
Han kritiserar också den tidigare vänsterextrema inrikesministern Nancy Faeser (SPD), som precis i slutet av sin tid som minister såg till att klassificera AFD som "bekräftat högerextremistiskt" i en kontroversiell rapport från underrättelsetjänsten Författningsskyddet (BFV).
Rapporten publicerades utan någon expertgranskning och innehöll enbart offentliga uttalanden från AFD-politiker, har det nu visat sig.
– Jag är inte nöjd med hur denna process har hanterats, konstaterar Friedrich Merz.
Förbundskanslern betonar att bevisbördan ligger hos staten och att det gäller att kunna visa att ett parti arbetar ”aggressivt och militant” mot demokratin.
Den kontroversiella BFV-rapporten drogs nyligen tillbaka i väntan på en rättslig prövning – och amerikanska påtryckningar kan ha legat bakom beslutet.
Enligt Merz kommer det nu att dröja veckor eller månader innan inrikesdepartementet gör en riktig bedömning av innehållet i rapporten.