FBI-chefen James Comey säger att Clinton visserligen hanterat hemligstämplad information "extremt vårdslöst", men att hon gjort det omedvetet.
Utredningen visar att 110 av de mejl som fanns på den privata mejlserverns i Hillary Clintons hem innehöll hemligstämplade uppgifter, rapporterar AP.
Clintons republikanske utmanare i presidentvalet, Donald Trump, kommenterar FBI:s beslut med att "systemet är riggat".
"FBI-chefen säger att oärliga Hillary äventyrade vår nationella säkerhet. Inget åtal. Wow!", skriver Trump på Twitter.
