Stämningen, som lämnats in i federal domstol i Miami, kräver minst 20 miljarder dollar i skadestånd. I det 18 sidor långa dokumentet anklagar Trumps juridiska team tidningens ägare, Dow Jones, för grova journalistiska övertramp.
"Något autentiskt brev eller teckning existerar inte", skriver Trumps advokat i stämningen.
Artikeln, som publicerades sent på torsdagen av journalisterna Khadeeja Safdar och Joe Palazzolo, återgav inte själva brevet eller bilden. Båda reportrarna nämns nu som svarande i målet.
"Wall Street Journal, och Rupert Murdoch personligen, varnades direkt av president Donald J. Trump att brevet de påstod kom från honom var en FÖRFALSKNING och att om de publicerade det skulle de stämmas", skrev Trump på Truth Social.
"Murdoch sade att han skulle ta hand om det. Men uppenbarligen hade han inte makten att göra det", tillade han.
En talesperson för Dow Jones kommenterade i ett kort uttalande:
– Vi har fullt förtroende för vår rapportering och kommer att försvara oss kraftfullt mot stämningen.
Artikeln har fått stor uppmärksamhet i USA, där Trumps kopplingar till Epstein åter hamnat i strålkastarljuset efter att hans regering har försökt mörka oklara delar av utredningen.
Epstein dog i ett fängelse i New York 2019 i väntan på rättegång för sexköpsbrott. Officiella utredningar slog fast att dödsorsaken var självmord, men många ifrågasätter detta.
Under valrörelsen 2024 lovade Trump att offentliggöra mer material om Epstein och hans kontakter med mäktiga personer.
Tidigare i juli släppte justitiedepartementet emellertid en PM som slog fast att det inte finns någon "kundlista" med namn på män som skulle ha begått brott tillsammans med Epstein. Detta har väckt ilska bland flera av Trumps mest lojala följare, och skapat en spricka inom MAGA-rörelsen.
Trump har en lång och komplicerad relation till Rupert Murdoch, vars företag även äger Fox News – en kanal där presidentens svärdotter Lara Trump numera är programledare.
Det är extremt ovanligt att en sittande president stämmer medier.
– Så vitt jag vet har ingen sittande president någonsin stämt en journalist, ett mediehus eller en mediechef för förtal, säger yttrandefrihetsexperten Ted Boutrous till CNN.
– Med presidentens plattform finns det helt enkelt inget behov av att stämma för att nå ut med sanningen.
Trump har däremot tidigare stämt flera mediebolag under sin pågående kampanj. I mars 2024 stämde han ABC och George Stephanopoulos för att ha sagt att en jury funnit honom skyldig till våldtäkt mot E. Jean Carroll.
Juryn fann Trump skyldig till sexuellt övergrepp, men inte till våldtäkt. ABC:s ägare Disney gick med på en förlikning och betalade 16 miljoner dollar – pengar som enligt uppgift ska gå till Trumps framtida presidentbibliotek.
Liknande uppgörelser har nyligen gjorts med CBS, Meta och X. Minst tre andra processer mot medie- och teknikföretag pågår fortfarande.
– Dessa attacker mot medierna underminerar yttrandefriheten genom att göra journalister mer försiktiga i sin bevakning av Trump och andra makthavare, säger juridikprofessor Carl Tobias vid University of Richmond.
Strax efter att stämningen lämnats in skrev Trump på Truth Social:
"Jag hoppas att Rupert och hans ’vänner’ ser fram emot de många timmarna av förhör och vittnesmål de kommer att behöva genomlida i det här målet."