Bland annat menar man att besöket kan uppfattas som att presidenten ger stöd till en regering som HWR anser är tveksam, rapporterar AP.
– På flera sätt tror jag man kan se det som en belöning, säger HWR-talesmannen Sarah Magon.
– I nuläget förtjänar Etiopien inte det.
Etiopien anklagas av västvärlden för att bland annat förfölja journalister och bloggare som är kritiska till landets regering. I april förra året greps flera journalister och bloggare anklagade för uppvigling och terrorism. Inför Obamas besök idag släpptes flera av dem, men en del av dem som greps då sitter fortfarande frihetsberövade.
För USA:s del ses dock Etiopien som en viktig allierad i kampen mot den somaliska terrorgruppen al-Shabab. Obama tog ändå upp vikten av att låta alla komma till tals i ett tal som han höll i Etiopien.
– När alla får göra sina röster hörda, när människor vet att de inkluderas i den politiska processen, då blir ett land mer framgångsrikt, sade han.
Obama besökte under helgen Kenya och fortsatte under måndagen sin Afrikaturné i Etiopien. Senare under måndagen mötte han med afrikanska ledare för att diskutera situationen i Sydsudan. I Sydsudan råder just nu ett invecklat inbördeskrig där bland annat olika afrikanska klaner och stammar slåss mot varandra.