Påven är "djupt bedrövad" över förlusten av liv och förnyar sin vädjan om en omedelbar vapenvila, skriver Vatikanen enligt Reuters.
Den katolska kyrkan angreps under torsdagen. Bilder från platsen visar kraftiga skador nära kyrkans huvudkors, och ett flertal fönster har krossats.
Kyrkans argentinske präst, fader Gabriele Romanelli – som tidigare hade daglig kontakt med påven Franciskus – skadades lindrigt i benet.
Patriarkatet fördömer anfallet och slår fast att ”ingenting kan rättfärdiga att oskyldiga civila blir måltavlor”.
Den israeliska försvarsmakten uppger att man "granskar" rapporterna om bombningen av kyrkan.