I en annan del av staden intog soldater den avgående premiärministern Carlos Gomes hem. "De sköt med raketgevär mot oss och vi var tvungna att fly", sa ett polisbefäl som vaktade hemmet. Han kunde inte uttala sig om regeringen befann sig i säkerhet.
En diplomat har via telefon till Associated Press meddelat att han inte kan gå ut på grund av stridigheterna.
-Militär har spärrat av stadskärnan, säger diplomaten.
-Jag kan också berätta att alla radiokanaler har varit tysta sedan klockan 8 ikväll torsdag och att vi inte har några uppgifter om vad som hänt regeringen, fortsätter han.
Gomes avsade sig posten som premiärminister i februari för att kunna ställa upp i det extrautsatta valet till president, sedan landets föregående president avled i januari. Valet skulle hållas i slutet av april och förväntades stå mellan Gomes och en tidigare president, Kumba Yala. Yala meddelade nyligen att han avsåg bojkotta valet.
Guinea-Bissua har sedan självständigheten från Portugal 1974 skakats av upprepade kupper. Det lilla landet med 1,6 miljoner invånare är ett av världens fattigaste.
