Frihedens Stemme lade upp åtalet på sin hemsida på tisdagen, men namnen var maskade innehöll inte identiteten på den 32-åring som åtalats för mordet.
I ungefär ett dygn låg åtalet uppe på sajten, men på onsdagsmorgonen stängdes hemsidan av leverantören One.com med hänvisning till ett domstolsbeslut och polisen.
I Danmark lämnas anonymiserade åtal ut till media, men med villkoret att det inte tillgängliggöras för andra och att de endast används för journalistiskt och redaktionellt arbete.
Nu riskerar Paludan tre års fängelse för att ha brutit mot lagen.
Själv säger han till Extrabladet att han inte var medveten om att åtal inte får publiceras, förutom om det råder förbud att publicera namn.
– Det avgörande för oss har varit att man som medborgare vet vad som hänt. Vi tycker inte att polisen ska diktera när det är lämpligt att publicera uppgifter om ett brott. Det måste pressen avgöra, säger Paludan till tidningen.