– Jag kanske gör er besvikna men vad vi vet dog han verkligen av en blodpropp, säger Budanov till ukrainska medier, rapporterar Expressen.
Aleksej Navalnyj, 47, avled i en straffkoloni i Sibirien den 16 februari, en händelse gett upphov till en rad konspirationsteorier.
Många världsledare – inklusive Sveriges statsminister Ulf Kristersson och USA:s president Joe Biden – gick omedelbart ut och slog fast att Putin personligen var ansvarig för dödsfallet.
De ryska myndigheterna uppger att Navalnyj föll ihop efter en promenad och att han därefter dog av naturliga omständigheter.
Oväntat nog går Kyrylo Budanov, chef för Ukrainas militära underrättelsetjänst, ut och bekräftar den ryska versionen av händelsen.
Till det ukrainska mediebolaget Hromadske uppgav spionchefen på söndagen att det är "mer eller mindre bekräftat" att Navalnyj avled av naturliga orsaker.
Detta lär vara pinsamt för Ukrainas president Volodymyr Zelenskyj, som själv var en av dem som omedelbart när dödsbudet kom hävdade att Putin mördat Navalnyj.