I två inlägg på tisdagen kommenterade Trump planerna på att genomföra allmän poströstning i Kalifornien under coronapandemin.
Enligt presidenten fanns det "noll chans" att ett sådant förfarande inte skulle leda till utbrett valfusk.
Twitter svarade med att sätta "faktakollstämplar" under inläggen. Sociala medier-jätten hänvisar till att "faktakollare" har kommit fram till att det inte finns "några bevis" för att poströstning skulle leda till valfusk.
Draget har fått Donald Trump att rasa.
"Twitter blandar sig nu in i presidentvalet 2020. De säger att mitt uttalande om poströstning, som kommer att leda till massiv korruption och bedrägerier, är felaktigt, baserat på faktakollar från fake news-CNN och Amazons Washington Post. Twitter kväver yttrandefriheten helt och jag som president kommer inte att låta det ske", skriver han på Twitter.
Trump är själv en mycket flitig användare av Twitter. Samtidigt är sajten känd för sin starka slagsida åt vänster, och en mycket lång rad av Trumps anhängare på högerkanten har tidigare blivit censurerade eller fått sina konton avstängda från plattformen.