Paludan har sagt att han vill "markera lite yttrandefrihet" mot Turkiet efter landets fördömanden av en tidigare aktion som genomfördes förra veckan.
PKK-organisationen Rojavakommittéerna hängde då upp en docka föreställande Turkiets president utanför Stockholms stadshus.
– Grundlagen ger ett starkt skydd och man ska bedöma värdet av att få demonstrera och yttrandefriheten väger tungt och det är det man tagit med i vågskålen, säger Ola Österling, presstalesperson vid polisen till TT.
Koranränningen kommer att ske i samband med två andra demonstrationer i Stockholm, en av dem är proturkisk och ska ske vid ambassaden. Den andra demonstrationen är emot Sveriges Natoanslutning och mot Erdogan.