Beslutet meddelades på torsdagen och följer på att landet i juli stoppade två folkmordsbetonade israeliska ministrar, Bezalel Smotrich och Itamar Ben-Gvir, från inresa.
Slovenien, som i fjol erkände en palestinsk stat, har redan infört vapenembargo mot Israel i augusti och ett importförbud för varor producerade i de ockuperade palestinska områdena.
Enligt Sloveniens utrikesminister Tanja Fajon syftar åtgärderna till att stoppa lidandet för civilbefolkningen i Gaza.