Enligt grekisk polis hittades de 92 nakna männen nära gränsfloden Evros, som skiljer Turkiet och Grekland åt, under fredagen.
Männnen uppgav sig ha tvingats till gränsen av turkiska myndigheter och därefter tvingats klä av sig nakna och paddla gummibåt i riktning mot Grekland.
– Turkiets provokativa beteende överskrider alla gränser, säger en talesperson för Greklands invandrings- och asyldepartement på lördagen.
En talesperson för den turkiske presidenten avfärdade dock uppgifterna som "falska nyheter".
"Det grekiska fake news-maskineriet är igång igen", hette det i ett uttalande från presidentens stab på Twitter.
FN kräver nu en oberoende utredning av det inträffade.