Först ut redan i torsdags var den amerikanska rymdflygstyrelsen NASA som klarade sig undan budgeterade nedskärningar. Myndigheten måste dock fortfarande rätta sig efter den kvarstadsparagraf som trädde i kraft den 1 mars i år, vilken innebär att NASA:s budgetanslag automatiskt bantas 5 procent. Den amerikanska kongressen vill att NASA fortsätter att satsa på planetforskning, i synnerhet fler expeditioner till planeten Mars. Totalt får NASA ungefär 17 miljarder dollar under året för att finansiera sin verksamhet.
Den medicinska forskningsmyndigheten NIH får inga ytterligare anslag och måste därmed banta sin budget med knappt 5 procent, eller 1,5 miljarder dollar. NIH står för en dryg fjärdedel av USA:s medicinska forskning och är den största statliga finansiären av forskning i världen.
Myndigheten NSF är ansvarig för federala satsningar inom andra forskningsområden än medicin och kan ses som en motsvarighet till NIH inom discipliner som matematik, datavetenskap, ekonomi och samhällsvetenskap. NSF klarar sig undan med begränsade nedskärningar inom alla områden utom samhällsvetenskap som får långtgående ställda krav på sig. NSF ska framledes endast bevilja ekonomiskt stöd till samhällsforskning som främjar "nationens säkerhet" eller USA:s "ekonomiska intressen".
Smithsonianinstitutet drabbas även den av det generella kvarstadsparagrafen, men institutet bedömer att man kommer att klara av nedskärningarna genom anställningsstopp, inställda underhåll och en minskning av externa upphandlingar för de 19 museum och gallerier, sex forskningsanläggningar och den djurpark man driver.
Inrikessäkerhetsdepartementet, mer känt som Department of Homeland Security, bedriver även det forskning, framförallt inom hur man kan förebygga effekterna av naturkatastrofer såsom orkaner och jordbävningar. Myndigheten har dessutom bett om och beviljats pengar för byggandet av en ny bioforskninganläggning i Kansas, forskning som mött stark kritik och utgjort grogrund för konspirationsteorier. Anläggningen planeras hålla den högsta biologiska skyddsnivån på en fyrgradig skala.
Energidepartementets forskningsprogram skärs ned med de drygt 200 miljoner dollar som kvarstadsparagrafen innebär, omkring 5 procent av departementets totala forskningsbudget.
NOAA, ett institut som påminner om svenska SMHI och det vetenskapliga organ som forskar på frågor som berör hav och atmosfär, berörs även de när USA sparar. NOAA är dock ett av de forskningsorgan som klarar sig bäst vid budgetnedskärningarna, något man kan tacka orkanen Sandy, den orkan som drabbade USA i höstas, för. De 159 amerikanska liv orkanen skördade påminner kongressen om vikten av fortsatt forskning på de komplexa vädersystem som gång på gång drar in över landet.