Beslutet kommer efter att Hamas och andra islamistiska grupperingar ökat sin aktivitet på egyptiska Sinaihalvön med bland annat flera terrordåd mot egyptier, rapporterar AP.
– Det har bortom tvivel bevisats att Hamas har utfört sabotage, mord och dödandet av oskyldiga civila samt medlemmar av egyptens väpnade styrkor och den egyptiska polisen, hette det i ett utlåtande från domstolen.
Förra månaden terrorstämplades Hamas väpnade gren, Qassam-brigaden, av en egyptisk domstol och nu går man alltså ett steg längre och terrorstämplar hela den palestinska organisation som styr över Gazaremsan.
Hamas anklagas även för att samarbeta med Muslimska brödraskapet som styrde Egypten i ett drygt år fram till juli 2013 då president Mohammed Morsi, som tillhörde brödraskapet, avsattes av den egyptiska militären efter att miljoner männniskor gått ut på gatorna i massdemonstrationer där de krävde att islamisterna skulle störtas från makten.
På den Hamaskontrollerade Gazaremsan kallades gårdagens beslut "en stor skam" och ett beslut som "tjänar den israeliska ockupationen".