Enligt stämningsansökan, som lämnades in till domstolen i tisdags, pågick övergreppen mellan den 1 april och 5 juni i år.
Den åtalade mannen är i 35-årsåldern och bor sambo med en annan man, enligt folkbokföringen är paret inte gifta eller i registrerat partnerskap.
Av handlingar från domstolen som Fria Tider tagit del av framgår att den våldtäktsåtalade mannen haft flera orala och anala samlag med pojken, både i sitt hem och i en bil.
I polisförhör har mannen erkänt sexuellt övergrepp mot barn, men nekar till att ha gjort sig skyldig till våldtäkt mot barn.
