Försvarsminister Sergej Sjojgu hänvisar till en analys av "militärpolitiska, sociala och historiska faktorer som påverkar läget i regionen" som grund för beslutet.
Han vill framför allt stärka försvaret i riktning mot Kaliningrad.
– Denna verksamhet utesluter dock inte att det militära samarbetet med Östersjöstater fortsätter på basis av grannskap och respekt för varandras intressen, säger ministern enligt Sputnik News.
Satsningen ska "tillförsäkra Rysslands intressen i Östersjöregionen", skriver regeringsorganet.