Det var i onsdags som 150 tyska poliser slog till mot sex olika platser, däribland Mevlana-moskén i Berlin, i en utredning om bedrägeri om coronavirusbidrag.
Polisen beslagtog 7.000 euro i moskén samt flera digital lagringsenheter.
En av de misstänkta i härvan har kopplingar till moskén.
Turkiets president Erdogan rasar mot razzian.
– Jag fördömer kraftigt polisrazzian mot Mevlana-moskén i Berlin under morgonbönen, säger han i ett uttalande.
– Räden baseras uppenbarligen på rasism och islamofobi, som kommer föra Europa närmare medeltidens mörker, och som helt ignorerar trosfriheten, fortsätter presidenten.
Turkiets utrikesdepartementet har tidigare kallat polisens tillslag mot moskén för en "ful" och "avskyvärd" handling. Enligt den turkiska regeringen var det "oacceptabelt" att polisen störde bönen och gick in i moskén med sina stövlar, något som är förbjudet enligt islam.
I Tyskland finns cirka 3 miljoner turkar.