Det var under ett partimöte på söndagen som Putin uttryckte oro över de civila som flyr från Afghanistan efter talibanernas maktövertagande.
– Vilka är dessa flyktingar? Hur vet vi det? De kan vara tusentals, eller till och med miljontals. Gränsen är tusen kilometer lång. De kommer att kliva på vad som helst – en bil, till och med en åsna – och fly över stäppen, sade den ryske presidenten enligt RT.
Detta potentiella säkerhetshot "är ett direkt bekymmer för våra medborgare", fortsatte Putin och tillade:
– Vi vill inte att krigare förklädda till flyktingar ska dyka upp i vårt land.
Putin förklarade också att en av anledningarna till att Ryssland stridit mot Islamiska staten i Syrien och tillhandahållit militärt stöd till landets president Bashar al-Assad har varit att förhindra att Syrien "förvandlas till någon form av Afghanistan och bli en grogrund för terrorism".
Både Islamiska staten och talibanerna klassas som terrorgrupper och är förbjudna i Ryssland.