Förslaget, som kommer från migrationskommissionär Dimitris Avramopoulos, rör invandrare som kommer till Italien och Grekland och som EU nu vill fördela enligt ett kvotsystem som tar hänsyn till medlemsländerna folkmängd och ekonomi.
Sveriges kvot skulle enligt systemet hamna på 1.369 asylsökare, medan Tyskland skulle tvingas ta emot 8.763 personer.
Förutom de 40.000 asylsökarna från Syrien och Eritrea vill kommissionen också fördela 20.000 så kallade kvotflyktingar på ett liknande sätt.
För att förslaget ska bli verklighet måste en majoritet av medlemsländerna rösta för det. Länder som Storbritannien, Danmark, Ungern, Polen och Finland har dock redan visat sitt missnöje med planerna.
EU-kommissionen har avsatt 2,3 miljarder euro till ersättningar för att blidka kritikerna. Tanken är att medlemsländerna ska få motsvarande drygt 56.000 kronor för varje tilldelad asylsökare.
EPP, som är EU-parlamentets största partigrupp, har redan välkomnat kvotsystemet.
– Detta är ett första steg och borde följas av av ett permanent system, säger den maltesiska ledamoten Roberta Metsola enligt Europaportalen.
Europaparlamentarikern Cecilia Wikström (FP) hoppas att de bångstyriga länderna ska ge med sig i förhandlingarna.
– Nu är detta ett svar på en kris som utspelar sig framför vår tröskel. Den måste vi naturligtvis med gemensamma krafter lösa och den gemensamma ansträngningen heter att ta ett gemensamt, europeiskt ansvar för detta och det gör vi nu, säger hon till Sveriges Radio.
