Fyra stridsflygplan attackerade fabriken i Yarmouk, sa Sudans informationsminister Ahmed Bilal Osman under onsdagen.
Vi tror att Israel ligger bakom bombningen, forsätter han samtidigt som han hävdar Sudans rätt att slå tillbaka.
Israel vägrar att kommentera anklagelserna. Detta är inte första gången Israel anklagas av de sudanesiska myndigheterna för att ligga bakom attacker i landet. I april 2011 anklagades Israel för att ligga bakom en missilattack mot en bil nära Port Sudan som dödade två människor. Under 2009 attackerades en militärkonvoj från luften och dussintals dog, vilket också skylldes på Israel.
Bombräden skedde runt midnatt lokal tid natten till onsdagen och Sudan säger sig ha bevis för Israelisk inblandning i form av en blindgångare från flygplanen som ska lämnas in till FN:s säkerhetsråd.
Al-Jazeera rapporterar att flera vittnen ska ha sett flygplan flyga in över området före explosionen. Oppositionskällor uppger att fabriken är iransk, skriver Haaretz.
Fabriken som bombades ligger i Khartoum, Sudans huvudstad, och är inom räckhåll för stridsflyg från Israel, men det finns även israeliska militärbaser i grannlandet Etiopien.
