EU-parlamentet, där hon är ledamot sedan 2009, hävde hennes åtalsimmunitet under en omröstning under tisdagen, på begäran av fransk domstol.
Under ett valtal 2010 jämförde Le Pen muslimska bönestunder med nazistisk ockupation, vilket föranledde Fransk polis att inleda en förundersökning om åsiktsbrott.
Jag är ledsen, men de som gärna pratar om andra världskriget, om det nu handlar om ockupation, då kunde man också tala om [de muslimska bönestunder på franska gator], eftersom det är en ockupation av franskt territorium, sa Marine Le Pen på ett valmöte i södra Frankrike i december 2010.
Hon kan nu komma att åtalas för yttrandet.
Jag står vid mitt ord och kommer att försvara det i domstol, säger Marine Le Pen till fransk TV.
Jag är övertygad om att rätten kommer att döma i min favör och skydda min rätt att säga sanningen till det franska folket, fortsätter hon.
EU-parlamentariken Cecilia Wikström (FP), är av annan åsikt.
Jag är glad att Europaparlamentet med bred marginal valde att gå på den linje som jag rekommenderat, alltså att häva immuniteten för Marine Le Pen. Nu är det upp till det franska rättsväsendet att hantera den fortsatta processen, säger Wikström, som varit drivande bakom beslutet, i ett pressmeddelande.
Marine Le Pen har blivit ett allt större hot mot den etablerade partipolitiken i Frankrike. Om det vore val idag skulle hon få fler röster än den sittande socialistpresidenten Francois Hollande, enligt opinionsundersökningar.