– Vi har tittat noga på de remissvar som inkommit. Vår bedömning är att vårt nya förslag är väl avvägt, säger finansmarknadsminister Per Bolund i ett pressmeddelande.
Nordea har tidigare hotat med att flytta sitt huvudkontor från Sverige på grund av den svenska regeringens förslag om höjda bankavgifter.
Förra hösten ville regeringen Löfven beskatta bank- och finanstjänster med 15 procent. I februari slopades förslaget efter hård kritik. I stället föreslog man att avgiften till den så kallade resolutionsreserven skulle höjas. I så fall är risken "mycket, mycket stor" att Nordea flyttar huvudkontoret från Sverige, sade Nordeas vd Casper von Koskull till Dagens industri i mars.
En höjd resolutionsavgift skulle nämligen innebära en ökad kostnad för Nordea på 5-6 miljarder kronor jämfört med tidigare år.
På torsdagsmorgonen meddelade regeringen att resolutionsavgiften, precis som aviserats, kommer höjas.
– Sverige har en stor, koncentrerad och växande banksektor. Det innebär att det i Sverige finns behov av en stor resolutionsreserv, säger finansminister Magdalena Andersson.
Avgiften höjs nästa år, men kommer sedan trappas av från 2019.
Resolutionsavgiften ska vara 0,125 procent av avgiftsunderlaget för 2018, 0,09 procent för 2019 och 0,05 procent från och med 2020 fram tills fonden beräknas vara fylld 2025, skriver regeringen.
Den 19 maj uppgav källor till SvD att Nordea redan bestämt sig för att flytta huvudkontoret från Sverige.
Men vart huvudkontoret kommer flyttas framgår inte av SvD:s källor. Tidigare i maj skrev Bloomberg News att Nordea planerar flytta kontoret till Köpenhamn eller Helsingfors.
– Vi vill minska avgifter och skatter och vi kommer inte införa fler regler. Vårt svar kommer alltid att vara: färre regler, sade Danmarks näringsminister Brian Mikkelsen till Bloomberg News.
Resolutionsavgiften syftar till att lägga större ansvar på bankerna och skydda skattebetalarna från kostnader under bankkriser.