Det är på två skolor i Vingåker i Sörmland som det ska ha förekommit bön och Koranläsning under modersmålsundervisning.
Detta ska redan ha påtalats för barn- och utbildningsförvaltningen, men ändå fortsätter det.
Därför har en anonym anmälan nu gjorts till Skolinspektionen.
Rektorn på den ena skolan är sedan tidigare medveten om problemet och hävdar att han sagt till berörda personer.
– Det är helt oacceptabelt. Det finns ett tydligt regelverk kring vad som gäller för undervisningen, och religiöst innehåll ska inte förekomma på skolan, säger han till SVT.
Enligt läroplanen måste all undervisning vara icke konfessionell.
Vingåkers kommun ska ge sitt yttrande i ärendet till Skolinspektionen senast på fredag den 4 maj.
